高深度血液蛋白組
> 技術(shù)簡介
血液樣本具有以下幾個(gè)優(yōu)勢:
1.血液具有復(fù)雜的蛋白質(zhì)構(gòu)成,反映著不同部位的蛋白亞群分布特征。
2.血液樣本易于獲得。
3.血液可動(dòng)態(tài)反應(yīng)機(jī)體的狀態(tài)變化,這有利于更全面的了解疾病的發(fā)生發(fā)展進(jìn)程。
4.血液的采集方法已經(jīng)成熟,對于血液的其他臨床指標(biāo)也有成熟的檢測技術(shù),可以為研究者提供更全面的信息。
蛋白質(zhì)是血液樣本中最重要的大分子物質(zhì),其可作為生物功能的直接執(zhí)行者,其變化可作為標(biāo)志物來表征疾病的發(fā)生與發(fā)展。但是,血液樣本中存在許多高豐度蛋白,例如血清白蛋白占血液中蛋白總量的80%以上。因此,我們在對血清/血漿樣本進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)研究時(shí),需要對其進(jìn)行去高豐度或富集低豐度蛋白的處理。
> 技術(shù)原理
研究借助磁珠的比表面積大及吸附活性高的優(yōu)點(diǎn)對血液中的低豐度蛋白進(jìn)行富集。
> 技術(shù)優(yōu)勢
高深度:一次可鑒定2500+蛋白
實(shí)驗(yàn)操作簡單
高穩(wěn)定性和重復(fù)性
樣本適用范圍廣,無物種限制
> 應(yīng)用領(lǐng)域
生物標(biāo)志物研究、疾病機(jī)制研究、藥物作用靶點(diǎn)研究、用藥及預(yù)后研究、細(xì)胞異質(zhì)性研究、特殊功能蛋白篩選。
> 技術(shù)路線

> 實(shí)驗(yàn)儀器
Orbitrap Exploris™ 480(Thermo Fisher)
Orbitrap Exploris™ 240(Thermo Fisher)
Q Exactive HF-X(Thermo Fisher)
Orbitrap Fusion™ Lumos™ Tribrid™(Thermo Fisher)
Orbitrap Fusion™ Tribrid™(Thermo Fisher)
> 數(shù)據(jù)分析
數(shù)據(jù)質(zhì)控結(jié)果;蛋白定性定量結(jié)果;蛋白差異分析;火山圖(Volcano);表達(dá)豐度箱式圖;平行樣本相關(guān)性分析;主成分分析(PCA);層次聚類分析(Heatmap);表達(dá)模式聚類分析;數(shù)據(jù)交疊分析(Venn);差異蛋白GO功能注釋及富集分析;差異蛋白Pathway功能注釋及富集分析;蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建;個(gè)性化定制分析
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